RSI PKU Muhammadiyah Pekajangan pada awal berdirinya yaitu tahun 1963, didirikan sebagai Rumah Bersalin Aisyiyah, Seiring dengan perkembangannya di tahun 1967 Rumah Bersalin Aisyiyah berganti menjadi Balai Pengobatan Aisyiyah yang pengelolaanya diserahkan kepada Muhammadiyah Cabang Pekajangan dan atas bimbingan dari RSI Muhammadiyah Roemani Semarang, Balai Pengobatan Aisyiyah dikembangkan menjadi Rumah Sakit sejak 17 Juni 1988 hingga sekarang.